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在无尘车间的应用中，除了根据洁净度要求对不同粒径大小的尘埃颗粒进行控制和净化以外，菌落控制也是其中一个环境管控点，尤其是制药、医疗器械、生物、食品行业应用的无尘车间或实验室对菌落有严格要求。日常生活中，最常见的是霉菌的生成，根据国外文献和实证研究，洁净室霉菌形成是需要一定的湿度条件的。
通常，制药GMP无尘车间的最大湿度控制在70%以下是可以避免霉菌形成的，因此对于GMP监测点，湿度探头设置的警戒线常为60%，行动限70%。只有在长时间相对湿度较高时，才有形成霉菌的风险，文献指出，每天超过3个小时的表面湿度达到60%-100%就存在风险。如果表面湿度达到80%每天达12小时以上，持续5天的话，那么霉菌就可能会来临了。
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